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      李奇淵

      發(fā)布日期:2022-11-22     點擊數(shù):次

      李奇淵,丹麥科技大學獲博士學位,后又在美國哈佛醫(yī)學院從事博士后研究,期間,以共同第一作者身份在Nature Medicine上發(fā)表了論文。

      擔任廈門大學健康醫(yī)療大數(shù)據(jù)國家研究院副院長;同時擔任廈門大學附屬第一醫(yī)院兒科科研外聘主任,支持兒科智能化研究。以第一作者和通訊作者的身份在Cell、Nature communication、Cancer Research、EBioMedicine等國際知名期刊上發(fā)表論文。


      李奇淵教授主要致力于生物信息統(tǒng)計方面的研究,目前的主要研究方向包括:

      1. 運用統(tǒng)計學模型從遺傳多態(tài)性,體細胞變異,表觀基因組學和基因表達等多組學數(shù)據(jù)中尋找與腫瘤分型,預后,靶向治療敏感性等臨床特征有關的決定因子并解釋其調控機制;在此基礎上建立基于多組學關聯(lián)的復雜網(wǎng)絡模型,應用人工智能方法發(fā)現(xiàn)新的腫瘤驅動基因。

      2. 基于圖神經(jīng)網(wǎng)絡的跨細胞系染色質三維結構預測,利用GCN框架預測跨細胞系Hi-C數(shù)據(jù)和表達數(shù)量性狀位點(Expression Quantative Trait Loci, eQTL)。

      3. 單細胞轉錄組算法研究:基于K-means和Louvain的大型單細胞聚類算法;基于最小無偏代表點(MURP)的降采樣算法;基于單細胞轉錄組的時間分化軌跡研究;基于單細胞轉錄組的空間重構。

      4. 利用單細胞測序技術研究母胎界面免疫微環(huán)境中T淋巴細胞演進路線的重建及其轉錄調控;利用單細胞測序技術研究吸煙對于肺癌免疫微環(huán)境的影響。

      5. 基于無創(chuàng)產前檢測(NIPT)的體細胞突變圖譜與腫瘤的關聯(lián)性研究。

      廈門市醫(yī)保定點醫(yī)藥機構布局規(guī)劃專項業(yè)務,本項目應用網(wǎng)格化地理信息管理和大數(shù)據(jù)技術,實現(xiàn)對廈門市參保人口醫(yī)保資源有效供給的精準化評價和管理,對廈門市新增定點醫(yī)療機構和藥店的地理設置提供實時評估和咨詢;向醫(yī)保管理部門和社會提供實時精準的資源呈現(xiàn),為醫(yī)保定點醫(yī)療機構存量管理和增量規(guī)劃提供統(tǒng)計依據(jù)。


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