一、案例介紹

下圖數據為A基因和B基因的表達量（范例數據為隨機數據，無生物學意義），根據數據作基因表達相關性散點圖。

二、軟件操作方法

1、打開Graphpad Prism軟件，圖表類型選擇“XY”，勾選“Enter and plot a single Y value for each point”，點擊“Creat”創(chuàng)建新圖表。（圖1）

圖1 創(chuàng)建XY圖表

2、寫入/導入數據（圖2）。

圖2 數據錄入

3、找到Graphs（圖3），點擊以上數據對應的名稱，就可生成圖形。

圖3 生成圖形

4、點擊Analysis中的“Fit a line with the linear regression”，對線性回歸的數據和參數進行設置。一般不需要做任何個性化設置，點擊OK后即可獲得A基因和B基因的相關性趨勢曲線。（圖4）

圖4-1 添加相關性趨勢線

圖4-2 添加相關性趨勢線

圖4-3 添加相關性趨勢線

5、查看統(tǒng)計結果：點擊“Result”選擇中“Linear reg. of data 1”，R²和P值（圖5），分別代表數據的線性情況和顯著性。其中：r為相關性系數，r的值介于+1和-1之間，其絕對值越靠近1說明相關性越強，正負表示相關的方向，正值說明為正相關，負值說明為負相關。

圖5 查看統(tǒng)計分析結果

6、圖形調整與優(yōu)化：（1）調整命名，可選擇刪除Data1、X title和Y title標題，重新命名；（2）可以利用change版塊調整圖片，也可以直接雙擊圖形/坐標軸修改圖片大小、顏色、X軸Y軸等信息；（3）繪制好的圖形中添加R²和P值。（圖6）

圖6 圖形優(yōu)化